ในโลกที่ “สาวน้อยเวทมนตร์” ไม่ใช่เพียงฮีโร่ในนิทาน แต่เป็นอาชีพที่มั่นคง ได้รับค่าตอบแทนสูง และเป็นที่ใฝ่ฝันของผู้คน ซากุรางิ คานะ หญิงสาวผู้ค้นพบพรสวรรค์ด้านเวทมนตร์ระหว่างการสมัครงาน ได้ก้าวเข้าสู่ บริษัทจำกัด แมจิลูเมียร์ ในฐานะพนักงานใหม่
แม้จะเป็นเพียงสาวน้อยเวทมนตร์มือใหม่ แต่คานะก็ได้รับโอกาสให้ทำงานเคียงข้าง โคชิงายะ ฮิโตมิ รุ่นพี่ผู้เปี่ยมด้วยฝีมือและมีบุคลิกไม่เหมือนใคร เพื่อรับมือกับภัยพิบัติปริศนาที่เรียกว่า “ความผิดปกติ” ซึ่งคุกคามชีวิตผู้คนในทุกวัน
ท่ามกลางภารกิจอันตราย คานะค่อย ๆ เรียนรู้ความหมายของการเป็นสาวน้อยเวทมนตร์ ทั้งความรับผิดชอบ คุณค่าของชีวิต และอุดมการณ์ของบริษัทที่ยืนหยัดเพื่อปกป้องผู้คน จนเติบโตขึ้นทั้งในฐานะพนักงานมืออาชีพและผู้ใช้เวทมนตร์
แต่หลังจากเข้าร่วมบริษัทได้เพียงหกเดือน การปรากฏตัวของ “ความผิดปกติ” รูปแบบใหม่ กลับนำพาโลกเข้าสู่ความเปลี่ยนแปลงครั้งใหญ่ พร้อมการเปิดตัว “ระบบอลิซ” เทคโนโลยีเวทมนตร์ที่สามารถปรับใช้เวทมนตร์ให้เหมาะสมกับทุกสถานการณ์
ทว่า เบื้องหลังนวัตกรรมที่ดูเหมือนจะเปลี่ยนแปลงวงการ กลับซ่อนแผนการของกลุ่มอำนาจที่หวังใช้ประโยชน์จากพลังเวทมนตร์และเหล่าสาวน้อยเวทมนตร์เพื่อผลประโยชน์ของตนเอง
การต่อสู้ครั้งใหม่จึงเริ่มต้นขึ้น เมื่อคานะและพรรคพวกต้องเผชิญหน้ากับทั้งภัยพิบัติและความจริงที่ซ่อนอยู่ เพื่อปกป้องรอยยิ้ม ความหวัง และอนาคตของผู้คนทุกคน…